[Frank Münschke]

Das Problem ist das "Ziehen", weil dieses relativ unkontrolliert funxt und man dann normalerweise nicht auf die Einstellung, die gerade aktiv ist, achtet.
Ich habe deswegen damals - als noch alles aus Holz war und man mit dem Distiller PDFs erzeugen musste - immer das Datei-Öffnen-Menü verwendet oder im Netzwerk mit einer Ordnerstruktur gearbeitet, aus der sich der Distiller jeweils die Dateien holte und automatisch mit den jeweiligen Joboptions (abhängig vom jeweiligen Ordner) verknüpft umwandelte.
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In InDesign musst du immer in das Menü hinein und dann ist die Wahrscheinlichkeit größer, dass du an die Auswahl der richtigen Einstellung denkst ...